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Generelle Informationen zum Thema "Alles rund um Correlizer"
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Thread - Seiten: -1- Aktuellster Beitrag zuerst
03.08.2011, 06:30 Uhr

DoctorNowSupporter von BOINC@Heidelberg(40,m)
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Kaiser
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Avatar von DoctorNow

Die Projekt-URL: http://svahesrv2.bioquant.uni-heidelberg.de/correlizer/
Unser Team: http://svahesrv2.bioquant.uni-heidelberg.de/correlizer/team_display.php?teamid=9

Projektbeschreibung:

Zitat:
The sequential organization of genomes, i.e. the relations between distant base pairs and regions within sequences, and its connection to the three-dimensional organization of genomes is still a largely unresolved problem. Long-range power-law correlations were found using correlation analysis on almost the entire observable scale of 132 completely sequenced chromosomes of 0.5 ? 106 to 3.0 ? 107 bp from Archaea, Bacteria, Arabidopsis thaliana, Saccharomyces cerevisiae, Schizosaccharomyces pombe, Drosophila melanogaster, and Homo sapiens. The local correlation coefficients show a species-specific multi-scaling behaviour: close to random correlations on the scale of a few base pairs, a first maximum from 40 to 3,400 bp (for Arabidopsis thaliana and Drosophila melanogaster divided in two submaxima), and often a region of one or more second maxima from 105 to 3 ? 105 bp. Within this multi-scaling behaviour, an additional fine-structure is present and attributable to codon usage in all except the human sequences, where it is related to nucleosomal binding. Computer-generated random sequences assuming a block organization of genomes, the codon usage, and nucleosomal binding explain these results. Mutation by sequence reshuffling destroyed all correlations. Thus, the stability of correlations seems to be evolutionarily tightly controlled and connected to the spatial genome organization, especially on large scales. In summary, genomes show a complex sequential organization related closely to their three-dimensional organization.

Anwendungen gibt's derzeit für Windows, Linux (32- und 64-Bit) und Mac (32- und 64-Bit) und WUs gibbet auch schon.

Meine MundayWeb-Stats / eigene UotD-Liste / BOINCstats-Sig / PG-Stats
 
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03.08.2011, 06:53 Uhr

frankhagen(54,m)
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1.882 Beiträge
12.514.372 Credits (26.)
0 RAC (394.)



was einigermassen logisch ist - die app ist schon geraume zeit auf almeregrid (bzw. testgrid) gelaufen..
 
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03.11.2011, 14:31 Uhr

frankhagen(54,m)
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routinierter Obermaat
  BOINC-süchtig
1.882 Beiträge
12.514.372 Credits (26.)
0 RAC (394.)



total verpasst:

Linux running on an ARM compatible CPU 1.08 15 Oct 2011 | 3:45:12 UTC
 
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16.11.2011, 07:49 Uhr

Wassertropfen(44,m)
Team-Mitglied
  
interessierter Gefreiter
 
1.357 Beiträge
115.503.833 Credits (5.)
60.443 RAC (6.)

Avatar von Wassertropfen

Bei mir kam das Projekt eben an. Läuft bei mir in Heidelberg um die Ecke.

Steter Tropfen höhlt den Stein.
Constant dripping wears away the stone.
 
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27.05.2013, 23:13 Uhr

Saenger(48,m)
Teilnehmer
  
neugieriger Chefkoch
 
378 Beiträge

Avatar von Saenger

Kann mal einer von den echten Heidelbergern bei denen vorbeigehen und fragen, wann die Server wieder funktionieren?
Bei mir passiert gar nix, nicht mal die Web-Seite antwortet.

Grüße vom Sänger
 
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28.05.2013, 16:59 Uhr

Saenger(48,m)
Teilnehmer
  
neugieriger Chefkoch
 
378 Beiträge

Avatar von Saenger

OK, danke

Grüße vom Sänger
 
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